Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPMQ9NSP4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.6 ms