Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms