Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A4GALTQ9NPC4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms