Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KIAA1549Q9HCM3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms