Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC3GQ9HC16 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms