Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIN28AQ9H9Z2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms