Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMYD3Q9H7B4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms