Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C20orf27Q9GZN8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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C20orf27Q9GZN8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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C20orf27Q9GZN8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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C20orf27Q9GZN8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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C20orf27Q9GZN8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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C20orf27Q9GZN8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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C20orf27Q9GZN8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C20orf27Q9GZN8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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