Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMBRA1Q9C0C7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms