Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TDRD1Q9BXT4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms