Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SRRTQ9BXP5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SRRTQ9BXP5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms