Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFT27Q9BW83 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms