Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIRIP3Q9BW71 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIRIP3Q9BW71 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms