Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTDSS2Q9BVG9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTDSS2Q9BVG9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms