Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KATNB1Q9BVA0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms