Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM43Q9BTV4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms