Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms