Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms