Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms