Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT8L2Q96SF2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms