Protein–RNA interactions for Protein: Q96S99

PLEKHF1, Pleckstrin homology domain-containing family F member 1, humanhuman

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1Q96S99 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLEKHF1Q96S99 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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