Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC7Q96M83 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms