Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PRRC1Q96M27 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms