Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2E2Q96LR5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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