Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CPNE2Q96FN4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CPNE2Q96FN4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CPNE2Q96FN4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CPNE2Q96FN4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CPNE2Q96FN4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CPNE2Q96FN4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CPNE2Q96FN4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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