Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TM4SF18Q96CE8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM4SF18Q96CE8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms