Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms