Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HGDQ93099 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HGDQ93099 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HGDQ93099 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HGDQ93099 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HGDQ93099 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HGDQ93099 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HGDQ93099 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HGDQ93099 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HGDQ93099 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HGDQ93099 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms