Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C11orf40Q8WZ69 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C11orf40Q8WZ69 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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C11orf40Q8WZ69 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C11orf40Q8WZ69 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C11orf40Q8WZ69 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C11orf40Q8WZ69 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C11orf40Q8WZ69 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C11orf40Q8WZ69 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C11orf40Q8WZ69 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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C11orf40Q8WZ69 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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C11orf40Q8WZ69 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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C11orf40Q8WZ69 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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C11orf40Q8WZ69 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C11orf40Q8WZ69 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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