Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FNDC9Q8TBE3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms