Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HJURPQ8NCD3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms