Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTC29Q8NA56 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TTC29Q8NA56 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms