Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM71DQ8N9W8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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FAM71DQ8N9W8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM71DQ8N9W8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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