Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3A8

PARP8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP8Q8N3A8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARP8Q8N3A8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms