Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NME9Q86XW9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NME9Q86XW9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms