Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms