Protein–RNA interactions for Protein: Q70SY1

CREB3L2, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L2Q70SY1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CREB3L2Q70SY1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms