Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms