Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LLGL2Q6P1M3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LLGL2Q6P1M3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LLGL2Q6P1M3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LLGL2Q6P1M3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LLGL2Q6P1M3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LLGL2Q6P1M3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LLGL2Q6P1M3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LLGL2Q6P1M3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LLGL2Q6P1M3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LLGL2Q6P1M3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms