Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PPP4R4Q6NUP7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms