Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TYW3Q6IPR3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TYW3Q6IPR3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms