Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VIRMAQ69YN4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms