Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLX4IPQ5VYV7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLX4IPQ5VYV7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms