Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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FAM208BQ5VWN6 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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FAM208BQ5VWN6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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FAM208BQ5VWN6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM208BQ5VWN6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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