Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms