Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SAPCD1Q5SSQ6 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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