Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPAT3Q53EU6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPAT3Q53EU6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms