Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM16Q2WEN9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM16Q2WEN9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM16Q2WEN9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM16Q2WEN9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM16Q2WEN9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM16Q2WEN9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM16Q2WEN9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM16Q2WEN9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM16Q2WEN9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM16Q2WEN9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM16Q2WEN9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM16Q2WEN9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM16Q2WEN9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM16Q2WEN9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM16Q2WEN9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM16Q2WEN9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM16Q2WEN9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM16Q2WEN9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CEACAM16Q2WEN9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms