Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM71Q2Q1W2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms