Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Q1T7F1 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms